Számos vegyületet vizes oldatból végzett kristályosítással tisztítanak. A kristály számos szennyező anyagot kizár, azonban a víz belefér a kristályrácsba anélkül, hogy kémiailag kötődne a vegyület kationjához. A hő alkalmazása elvezetheti ezt a vizet, de az eljárás általában károsítja a kristályszerkezetet. Ez akkor jó, ha a tiszta vegyület előállítása a cél. Nemkívánatos lehet, ha a kristályokat kristályos vagy más célokra termesztik.
Időnként a két forma kombinálódik. Például [Cu (H2O)4]ÍGY4· H2Az O felhasználható a réz (II) -szulfát kristályosodási vízének leírására.
A víz egy kicsi, poláris molekula, amely könnyen beépül a kristályrácsokba, de nem ez az egyetlen oldószer, amelyet a kristályokban találnak. Valójában a legtöbb oldószer nagyobb vagy kisebb mértékben a kristályban marad. Általános példa a benzol. Az oldószer hatásának minimalizálása érdekében a vegyészek általában megpróbálják a lehető legnagyobb mértékben eltávolítani vákuum-extrakcióval, és melegíthetik a mintát, hogy eltávolítsák a maradék oldószert. A röntgenkrisztallográfia gyakran kimutathatja az oldószert a kristályon belül.