Mint minden tudós, Darwin sok ember kutatására épült tudósok, akik előtte jöttek. Még az ősi filozófusok is olyan történeteket és ötleteket hoztak fel, amelyeket az evolúció alapjául lehetne kezelni. Akkor miért kap Darwin hitelt az evolúcióelmélet előterjesztéséért? Ő volt az első, aki nem csak az elméletet, hanem a bizonyítékokat és egy mechanizmust (természetes szelekciót) tett közzé az evolúció történésére. Meg kell jegyezni, hogy Darwin eredeti kiadványa a természetes szelekcióról és az evolúcióról valójában közös dokumentum volt Alfred Russel Wallace, de a geológussal folytatott beszélgetés után Charles Lyell, Darwin gyorsan ment Wallace háta mögé, hogy összeírjon egy kivonatot, és közzétegye vitathatatlanul leghíresebb munkáját A fajok eredete.
Charles Darwin adatait és írásait 1858-ban megosztották a londoni Linnaean Társaság éves ülésén. Valójában Charles Lyell volt az, aki összeszerte Darwin munkáját Alfred Russel Wallace közzétett adataival, és belefoglalta a találkozó napirendjébe. A természetes szelekción keresztüli evolúció ötletét legjobban langyos fogadással fogadták el. Darwin még nem akarta közzétenni munkáját, mivel még mindig összeállította a darabokat, hogy kényszerítő érvet nyújtson be. Egy évvel később megjelent
A fajok eredete. A bizonyítékokkal teli és a fajok időbeli változásáról posztuláló könyvet szélesebb körben fogadták el, mint az ötletek eredeti kiadványát. Ennek ellenére továbbra is némi ellenállást tanúsított, és folytatta a könyv szerkesztését, és több bizonyíték és ötletek hozzáadásával többször is, amíg 1882-ben meg nem halt.A közhiedelemmel ellentétben Charles Darwin nem volt ateista. Valójában egy ponton papot tanulmányozott. Felesége, Emma Wedgwood Darwin, imádnivaló keresztény volt, és nagyon szoros kapcsolatban áll az Anglia Egyházával. Darwin megállapításai azonban az évek során megváltoztatta a hitét. Darwin által írt levelekben élettartama végén „agnosztikusnak” írná le magát. A hitben bekövetkezett változás nagy része valójában a lánya hosszú, fájdalmas betegségéből és halálából származik, nem feltétlenül az evolúcióval végzett munkájából. Azt hitte, hogy a vallás vagy a hit az emberi lét fontos részét képezi, és soha nem nevetett el és nem bántalmazta senkit, aki hinni akart. Gyakran idézték, hogy van valami magasabb hatalom lehetősége, de már nem követte a kereszténységet, és fájdalmas volt neki, hogy nem tud hinni a Biblia kedvenc könyveiben: a Evangéliumok. A liberális unitárius egyház valóban dicsérettel fogadta el Darwint és ötleteit, és elkezdett beépíteni az evolúció gondolatait a hitrendszerbe.
Úgy tűnik, hogy Charles Darwinnal kapcsolatos tévhit az ő vitathatatlanul leghíresebb könyvének címe A fajok eredete. Annak ellenére, hogy ez a cím látszólag az élet indulásának magyarázatára utal, nem ez a helyzet. Darwin semmiféle gondolatot nem ad arról, hogy miként kezdődött meg az élet a Földön, mivel ez az adatain kívül esett. Ehelyett a könyv felveti azt a gondolatot, hogy a fajok miként változnak az idő múlásával a természetes szelekcióval. Miközben feltételezi, hogy az egész élet valamilyen módon kapcsolódik egy közös őshez, Darwin nem próbálja megmagyarázni, hogyan jött létre ez a közös ős. Darwin evolúcióelmélete azon a kérdésen alapszik, amelyet a modern tudósok a makroevolúciót és a biológiai sokféleséget fognak figyelembe venni, mint mikroevolúció és az élet építőkövei.
Darwin küzdött annak eldöntése érdekében, hogy belefoglalja-e gondolatait az emberi evolúció publikációiban. Tudta, hogy ezek ellentmondásosak lesznek, és bár volt néhány felületes bizonyítéka és nagyon sok intuíciója a témáról, eleinte el akarta magyarázni az emberek fejlõdésének fejlõdését. Végül írt Az ember leszármazása és elmagyarázta hipotézisét az emberek fejlődéséről. Soha nem mondta, hogy az emberek majmokból fejlődtek ki, és ez az állítás az evolúció fogalmának általános félreértését mutatja. Az emberek rokonok a főemlősökkel, mint például a majmok, az életfán. Az emberek azonban nem majmok vagy majmok közvetlen leszármazottai, és a családfa másik ágához tartoznak. Pontosabb lenne azt mondani, hogy az emberek és a majmok unokatestvérek, hogy ezt ismert módon fogalmazzák meg.