Olyan sok tudományos tény van, amelyeket a tudósok és még a lakosság is magától értetődőnek tekint a modern társadalomban. Ezeknek a tudományágaknak a sokát, amelyeknek a józan észnek gondoljuk, még az 1800-as években még meg kellett vitatni Charles Darwin és Alfred Russel Wallace először összeállították az evolúció elméletét természetes kiválasztódás. Noha nagyon sok bizonyíték volt arról, hogy Darwin tudott róla, amikor elmélete megfogalmazódott, sok dolgot tudunk most, amit Darwin nem tudott.
Genetika, vagy annak tanulmányozása, hogy a tulajdonságok hogyan oszlanak át a szülõktõl az utódokig, még nem került kidolgozásra, amikor Darwin írta A fajok eredete. Az abban az időszakban a legtöbb tudós egyetértett abban, hogy az utódok valóban fizikai tulajdonságaikat a szüleiktől szerezték meg, de nem volt világos, hogy hogyan és milyen arányban. Ez volt az egyik fő érv, amelyet Darwin ellenfelei akkoriban elleneztek az elmélete ellen. Darwin nem tudta megmagyarázni a korai evolúcióellenes tömeg megelégedésére, hogy ez az örökség történt.
Csak az 1800-as évek végén és az 1900-as évek elején volt ez Gregor Mendel a borsó növényeivel megváltoztatta a játékát, és „genetika atyjának” vált ismertté. Annak ellenére, hogy munkája nagyon hangos volt, volt a matematikai hátteret, és helyes volt, hogy sokáig tartott ahhoz, hogy bárki felismerje Mendel felfedezésének jelentőségét a genetika.
Mivel a genetika területe az 1900-as évekig nem létezett, Darwin korának tudósai nem keresték azt a molekulát, amely generációról generációra hordozza a genetikai információkat. Miután a genetika fegyelme elterjedtebbé vált, sok ember rájött, hogy felfedezze, hogy melyik molekula hordozza ezt az információt. Végül bebizonyították, hogy DNS, egy viszonylag egyszerű molekula, amely csak négy különböző építőelemet tartalmaz, valójában a genetikai információk hordozója a Föld egész életében.
Darwin nem tudta, hogy a DNS meg fog történni fontos részévé válni az evolúció elmélete. Valójában az evolúció alkategóriáját nevezték mikroevolúció teljes mértékben a DNS-en és azon mechanizmuson alapul, amellyel a genetikai információt a szülõktõl az utódokhoz továbbítják. A DNS felfedezése, alakja és építőelemei lehetővé tették ezen változások nyomon követését, amelyek idővel felhalmozódnak az evolúció hatékony irányításához.
A puzzle egy újabb darabja, amely bizonyítékokat ad a Az evolúciós elmélet modern szintézise a fejlődési biológia ág Evo-Devo. Darwin nem ismerte a különféle szervezetek csoportjai közötti hasonlóságokat azzal, hogy miként alakulnak ki a megtermékenyítéstől a felnőttkorig. Ez a felfedezés nem sokáig nyilvánvaló volt, miután sok technológiai fejlődés elérhető volt, például nagy teljesítményű mikroszkópok, és az in vitro tesztek és laboratóriumi eljárások tökéletesítésre kerültek.
A mai tudósok megvizsgálhatják és elemezhetik, hogy az egysejtű zigóta hogyan változik a DNS és a környezet jelzése alapján. Képesek nyomon követni a különféle fajok hasonlóságait és különbségeit, és visszavezetni őket az egyes genetikai kódhoz petesejtek és sperma. A fejlődés számos mérföldköve ugyanaz a nagyon különböző fajok között, és rámutat arra a gondolatra, hogy közös életük létezik az élőlények valahol az életfáján.
Annak ellenére, hogy Charles Darwin-nak meglehetõsen hozzáférhetõ volt a kövületek melyeket az 1800-as évek során fedeztek fel, halála óta olyan sok további fosszilis felfedezés történt, amelyek fontos bizonyítékként szolgálnak az evolúció elméletének alátámasztására. Ezek közül az „újabb” kövületek közül sok emberi ősök amelyek segítenek támogatni Darwin azon gondolatát, hogy az emberek „módosulással származnak”. Míg a legtöbb bizonyítéka közvetett volt, amikor először feltételezte az ember gondolatát főemlősök és a majmokhoz kapcsolódtak, azóta számos fosszilát találtak, amelyek kitöltik az emberi evolúció üregeit.
Míg az emberi evolúció gondolata még mindig nagyon fontos a vitatott téma, továbbra is egyre több bizonyítékot fedeznek fel, amelyek elősegítik és felülvizsgálják Darwin eredeti ötleteit. Az evolúciónak ez a része valószínűleg ellentmondásos marad, mindaddig, amíg az összes közbülső az emberi evolúció kövületeit találtak, vagy a vallás és az emberek vallási meggyőződései megszűnnek létezik. Mivel ezek valószínűleg nem történnek meg, az emberi evolúció körül továbbra is fennáll a bizonytalanság.
Egy újabb bizonyíték, amelyre most szükségünk van az evolúció elméletének támogatásához, az, hogy a baktériumok hogyan tudnak gyorsan alkalmazkodni, hogy rezisztenssé váljanak antibiotikumokkal vagy más gyógyszerekkel szemben. Annak ellenére, hogy sok kultúrában az orvosok és orvosok a penészgombát baktériumgátlóként használják, az antibiotikumok első széles körű felfedezése és használata, mint például a penicillin, csak Darwin halála után fordult elő. Valójában az antibiotikumok baktériumfertőzések felírása csak az 1950-es évek közepéig vált normává.
A tudósok csak évekkel azután, hogy az antibiotikumok széles körű használata elterjedtek, megértették, hogy az antibiotikumok folyamatos expozíciója vezetheti az antibiotikumokat baktériumok fejlődnek és rezisztenssé válnak az antibiotikumok által okozott gátlásra. Ez valójában egy nagyon világos példa a működés során bekövetkező természetes szelekcióra. Az antibiotikumok elpusztítanak minden olyan baktériumot, amely nem rezisztens, de az antibiotikumokkal szemben ellenálló baktériumok életben maradnak és virágznak. Végül csak az antibiotikumokkal szemben rezisztens baktériumtörzsek működnek, vagy "a legmegfelelőbb túlélése"baktériumok történt.
Igaz, hogy Charles Darwinnak korlátozott mennyiségű bizonyítéka volt, amelyek a filogenetika kategóriába tartozhatnak, ám sok minden megváltozott, mióta először javasolta az evolúció elméletét. Carolus Linnaeus volt egy elnevezési és kategorizáló rendszere, amikor Darwin megvizsgálta adatait, ami segített neki ötleteinek megfogalmazásában.
Felfedezései óta azonban a filogenetikai rendszer drasztikusan megváltozott. Először a fajokat hasonló fizikai tulajdonságok alapján helyezték el a filogenetikus életfába. Ezen osztályozások közül sok megváltozott a biokémiai vizsgálatok felfedezése és a DNS-szekvenálás eredményeként. A fajok átrendezése az azonosítás révén befolyásolta és megerősítette az evolúció elméletét korábban hiányzott kapcsolatok a fajok között, és amikor ezek a fajok elágaztak a közönségükből ősök.