Számos szerkezet található a mezencephalonban, ideértve a tektumot, tegmentumot, az agytollót, arodás nigrát, a cerebrobiot és koponya idegek (oculomotor és trochlearis). Az tectum lekerekített dudorokból áll, úgynevezett colliculi, amelyek részt vesznek a látás és a hallás folyamatában. Az agytörzs egy idegrostok kötege, amely összeköti az elülső és a hátsó agyat. Az agytoll magában foglalja a tegementum (képezi a középső agy alapját) és a kicsi cerebri (idegvonalak, amelyek összekapcsolják a nagyagy a... val kisagy). Az feketeállomány idegkapcsolat van a elülső lebenyek és az agy más, a motoros funkciókban részt vevő területei. A jóindulatú nigra sejtjei dopamint is termelnek, egy kémiai hírvivõt, amely segít a koordinációban izom mozgalom.
Neurodegeneráció idegsejtek a szakirodalomban a dopamintermelés csökkenését eredményezi. A dopaminszint jelentős csökkenése (60-80%) a Parkinson-kór kialakulásához vezethet. A Parkinson-kór a idegrendszer rendellenesség, amely elveszíti a motoros irányítást és a koordinációt. A tünetek közé tartozik a remegés, a mozgás lassúsága, az izmok merevsége és az egyensúly problémája.