A bakufu volt a katonai kormány Japán 1192 és 1868 között, a shogun. 1192 előtt a bakufu - más néven shogonate- csak a hadviselésért és a rendõrségért felelõs volt, és szilárdan alárendeltje volt a császári bíróságnak. Az évszázadok során azonban a bakufu hatalma kibővült, és gyakorlatilag közel 700 évig Japán uralkodójává vált.
Kamakura időszak

Kezdve a Kamakura 1192-ben, Bakufu alatt, a shogunsok Japánt uralták, míg a császárok puszta figurák voltak. Az 1333-ig tartó időszak kulcsszerepe Minamoto Yoritomo volt, aki 1192 és 1199 között uralkodott a székhelyén, Kamakura-ban, Tokiótól kb. 30 mérföldre délre.
Ebben az időben a japán hadúrok hatalmat követeltek az örökletes monarchia és tudós-udvarosaik részéről, megadva a szamuráj harcosok- és uraik - az ország végső irányítása. A társadalom is radikálisan megváltozott, és új feudális rendszer alakult ki.
Az Ashikaga Shogonate
Az évek polgári vita után, amelyet a mongolok inváziója vált ki az 1200-as évek végén,
Ashikaga Takauji megdöntette a Kamakura bakufut, és 1336-ban Kiotóban létrehozta saját shogunátát. Az Ashikaga bakufu - vagy shogonate - 1573-ig Japánt uralta.
Ez azonban nem volt erős központi irányító erő, és valójában az Ashikaga bakufu tanúja volt a hatalmasok növekedésének daimjó az egész országban. Ezek a regionális urak uralkodtak tartományuk felett, nagyon kevés beavatkozással a kiotói bakufu miatt.
Az Ashikaga bakufu vége felé és azt követő években Japán csaknem 100 éves polgárháborúban szenvedett, amelyet főként a daimyo növekvő hatalma táplált. Valójában a polgárháborút a bakufu uralkodó küzdelem váltotta ki annak érdekében, hogy a harcoló daimyót visszavegye központi irányítás alá.

1603-ban azonban Tokugawa Ieyasu elvégezte ezt a feladatot, és létrehozta a Tokugawa shogunate-t vagy bakufu-t, amely 265 évig uralkodna a császár nevében. A japán Tokugawa-ban az élet békés volt, de a shogunális kormány erőteljesen ellenőrizte, ám egy évszázados kaotikus hadviselés után a béke nagyon szükséges pihenés volt.
A Bakufu bukása
Amikor az Egyesült ÁllamokMatthew Perry parancsnok 1853-ban bekerült az Edo-öbölbe (Tokió-öböl) és felszólította a Tokugawa Japánt, hogy tegye lehetővé a külföldi hatalmak kereskedelmét, akaratlanul események láncolatát indította el, amely Japán modern császári hatalommá való növekedéséhez és a bakufu.
Japán politikai elit felismerte, hogy az Egyesült Államok és más országok a katonai technológia szempontjából felülmúlják Japánt, és úgy érezte, hogy a nyugati imperializmus fenyegeti őket. Végül is hatalmas Qing Kína Nagy-Britanniában csak 14 évvel korábban térdre téve térdre Első ópiumháború és hamarosan elveszíti a második ópiumháborút is.
Meiji helyreállítása
Ahelyett, hogy hasonló sorsot szenvedne, Japán néhány elitje még szorosabbra akarta bezárni az ajtót a külföldi befolyás ellen, ám a láttatottabbak elkezdték megtervezni a modernizációs lépéseket. Úgy érezték, hogy fontos, hogy Japán politikai szervezetének központjában erős császár legyen, hogy megtervezze a japán hatalmat és megvédje a nyugati imperializmust.
Ennek eredményeként 1868-ban a Meiji helyreállítása kialudta a bakufu hatalmát, és visszatért a politikai hatalom a császárhoz. És a bakufu közel 700 éves japán uralma hirtelen véget ért.