Bármennyire vitatott Az evolúció elmélete van néhány körben, ritkán érvelnek azzal, hogy a mikroevolúció minden fajban megtörténik. Nagyon jelentős mennyiségű bizonyíték van erre DNS-változások és ez viszont apró változásokat okozhat a fajban, ideértve a több ezer évet is mesterséges kiválasztás tenyésztés útján. Az ellenzék azonban akkor fordul elő, amikor a tudósok azt állítják, hogy a nagyon hosszú ideig tartó mikroevolúció makroevolúcióhoz vezethet. Ezek a kis változások a DNS-ben összeadódnak, és végül újabb fajok alakulnak ki, amelyek már nem képesek szaporodni az eredeti populációval.
Végül is a több faj tenyésztése több ezer évig nem eredményezett teljesen új fajok kialakulását. Nem bizonyítja, hogy a mikroevolúció nem vezet a makroevolúcióhoz? Az a gondolat támogatói, hogy a mikroevolúció makroevolúcióhoz vezet, rámutatnak, hogy nincs elég ideje a földi élet története szerint, hogy megmutassák, vezet-e a mikroevolúció makroevolúció. Láthatjuk azonban új baktériumtörzsek képződését, mivel a baktériumok élettartama nagyon rövid. Szexuálisak, azonban a fajok biológiai meghatározása nem alkalmazandó.
A lényeg az, hogy ez az egyik vita, amelyet még nem sikerült megoldani. Mindkét fél jogos indokokkal rendelkezik az okok megfogalmazására. Lehet, hogy életünk során nem oldjuk meg. Fontos megérteni mindkét felet, és megalapozott döntést kell hozni a meggyőződéséhez illő bizonyítékok alapján. Az emberek nyitva tartása, miközben szkeptikussá válnak, gyakran a legnehezebb feladat, de a tudományos bizonyítékok figyelembevételekor ez szükséges.
A mikroevolúció a fajok molekuláris vagy DNS szintű változása. A Föld minden fajtája nagyon hasonló DNS-szekvenciákkal rendelkezik, amelyek minden jellemzőjét kódolják. Kis változások történhetnek mutációk vagy más véletlenszerű környezeti tényezők révén. Idővel ezek befolyásolhatják a rendelkezésre álló tulajdonságokat, amelyek a természetes szelekcióval továbbadhatók a következő generációhoz. A mikroevolúcióról ritkán vitatkoznak, és tenyésztési kísérletek vagy tanulmányok útján láthatók népességbiológia különféle területeken.
A fajok idővel változnak. Időnként ezek a mikroevolúció által okozott nagyon kis változások, vagy lehetnek nagyobb morfológiai változások, amelyeket a Charles Darwin és ma makroevolúciónak hívják. A fajok földrajzi, szaporodási minták vagy egyéb környezeti hatások alapján változhatnak. A makroevolúció ellentmondásos mikroevolúciójának mind támogatói, mind pedig ellenzői a specifikáció ötletét támasztják alá érveik alátámasztására. Ezért nem igazán rendezi a vitákat.
A makroevolúció volt az a fajta evolúció, amelyet Darwin az ő korában leírt. A genetikát és a mikroevolúciót Darwin halála után és csak azután fedezték fel Gregor Mendel közzétette borsónövény-kísérleteit. Darwin azt javasolta, hogy a fajok idővel megváltoztak a morfológiában és az anatómiában. A Galapagos pintyekkel kapcsolatos kiterjedt tanulmánya hozzájárult az evolúció elméletének kialakításához a természetes szelekción keresztül, amelyet manapság a makroevolúcióval társítanak.