Mivel Charles Darwin először jött fel a Az evolúció elmélete és ötlete természetes kiválasztódás, evolúció volt a vitatott tárgy sok embernek. Míg az elmélet támogatói rámutatnak a látszólag véget nem érő hegységre az evolúció bizonyítéka, a kritikusok továbbra is tagadják, hogy az evolúció valóban tény. Az evolúció elleni egyik leggyakoribb érv az, hogy sok hiányosság vagy "hiányzó lánc" van a fosszilis rekord.
Ezek a hiányzó kapcsolatok lennének azok, amelyeket a tudósok átmeneti kövületeknek tekintnek. Az átmeneti fosszilis anyagok egy szervezet maradványai, amelyek egy faj ismert verziója és a jelenlegi faj között kerültek be. Állítólag az átmeneti fosszíliák bizonyítékot jelentenek az evolúcióra, mert egy faj közbenső formáit mutatnák, és lassan változtak és adaptálódtak az alkalmazkodásban.
Sajnos, mivel a fosszilis adatok hiányosak, sok hiányzó átmeneti kövület található, amelyek elnémíthatják az evolúció kritikáját. Ezen bizonyítékok nélkül az elmélet ellenzői azt állítják, hogy ezeknek az átmeneti formáknak nem szabad létezniük, és ez azt jelenti, hogy az evolúció nem helyes. Vannak azonban más módok is, amelyek magyarázhatják néhány átmeneti fosszilis anyag hiányát.
A fosszilis anyagok előállításának egyik magyarázata található. Nagyon ritka, hogy egy elpusztult szervezet fosszilissé válik. Először, a szervezetnek a megfelelő területen kell meghalnia. Ennek a területnek valamilyen vizet kell tartalmaznia üledékekkel, például sárral vagy agyaggal, vagy a szervezetet kátrányban, borostyánban vagy jégben kell tartani. Még akkor is, ha a megfelelő helyen van, nem garantált, hogy kövületké válik. Nagyon hosszú időn át intenzív hőre és nyomásra van szükség ahhoz, hogy a szervezetet egy üledékes kőzetbe beágyazhassák, amely végül kövületré válik. Ezenkívül csak a kemény testrészek, például a csontok és a fogak segítenek abban, hogy ezt a folyamatot fosszilisré váljanak.
Még ha egy átmeneti organizmus fosszilis anyagot készítenek is, előfordulhat, hogy ez a fosszilis nem képes túlélni a Föld földrajzi változásait az idő múlásával. A sziklákat folyamatosan törik, megolvadják és különféle típusú kőzetekké változnak a sziklaciklus során. Ez magában foglalja az üledékes kőzeteket, amelyekben egy időben fosszilis tüskék voltak.
Ezenkívül a sziklarétegeket egymás fölé is lerakják. A szuperpozíció törvénye azt állítja, hogy a szikla régebbi rétegei a halom alján, míg az újabb vagy az üledékes kőzet fiatalabb rétegei, amelyeket külső erők, például a szél és az eső fektetnek le, közelebb vannak a tetején. Tekintettel néhány átmeneti kövületre, amelyeket még meg kell találni, több millió éves volt, valószínű, hogy ezeket még meg kell találni. Az átmeneti kövületek továbbra is ott lehetnek, de a tudósok egyszerűen nem mélyedtek le elég mélyre, hogy hozzájuk jussanak. Ezeket az átmeneti kövületeket olyan területeken is megtalálhatják, amelyet még nem fedeztek fel és feltártak. Még mindig fennáll annak a lehetősége, hogy valaki felfedezi ezeket a "hiányzó kapcsolatokat", mivel a Föld több részét felfedezik a terület paleontológusai és régészei.
Az átmeneti fosszilis anyagok hiányának további magyarázata az egyik hipotézis arra nézve, hogy az evolúció milyen gyorsan megy végbe. Míg Darwin állította, hogy ezek az alkalmazkodások és mutációk megtörténtek, és lassan épültek fel az úgynevezett folyamatban fokozatosság, más tudósok hisznek abban az ötletben, hogy nagy változások történtek, amelyek egyszerre történtek hirtelen, vagy elválasztott egyensúly. Ha a helyes az evolúció mintája pontosan egyensúlyi állapotban áll, akkor nem lennének olyan átmeneti szervezetek, amelyek átmeneti fosszíliákat hagynának el. Ezért a hihetetlen "hiányzó lánc" nem létezik, és az evolúcióval szemben ez az érv már nem lesz érvényes.