A glikozidkötéseket a második szénhidráton lévő atom azonosítása vagy a funkcionális csoport alapján jelöljük. Az első szénhidráton a hemiacetál vagy a hemiketál és a második molekula hidroxilcsoportja között létrejött kötés O-glikozidos kötés. Vannak még N-, S- és C-glikozidos kötések is. A koalens kötések a hemiacetál vagy a hemiketál –SR között tioglikozidokat képeznek. Ha a kötés SeR-hez kapcsolódik, akkor szelenoglikozidok képződnek. Az -NR1R2 kötés N-glikozidok. A -CR1R2R3-hoz való kötődéseket C-glikozidoknak nevezzük.
A kifejezés aglikon "ROH" bármely olyan ROH vegyületet jelent, amelyből a szénhidrát maradékot eltávolították, míg a szénhidrát maradékot a aglikon. Ezeket a kifejezéseket leggyakrabban alkalmazzák a természetben előforduló glikozidokra.
A kötés tájolása szintén megfigyelhető. α- és β-glikozid kötések a C1 szacharidtól legtávolabbi sztereocentrumon alapulnak. Α-glikozid-kötés akkor fordul elő, ha mindkét szén ugyanaz a sztereokémia. Β -glikozidkötés akkor képződik, ha a két szén eltérő sztereokémiával rendelkezik.