Az izomerek olyan molekulák, amelyek azonosak kémiai formula de az egyes atomok eltérően vannak elrendezve a térben. A geometriai izomerizmus az izomer típusát érinti, ahol az egyes atomok azonos sorrendben vannak, de képesek egymástól eltérően térbeli elrendeződést kialakítani. A cisz és a transz előtagokat a kémiában használják a geometriai izomerizmus leírására.
Ez a molekula 1,2-diklór-etán (C2H4Cl2). A zöld golyók a klóratomot képviselik a molekulában. A második modell a molekula a központi szén-szén egyszeres kötés körül. Mindkét modell ugyanazt a molekulát képviseli és van nem izomerek.
Ezek a molekulák 1,2-diklór-etén (C2H2Cl2). Ezek és az 1,2-diklór-etán közötti különbség a két hidrogénatom között a két szénatom közötti kiegészítő kötés helyébe lép. Kettős kötések akkor képződnek, amikor a két atom közötti p-arbitál átfedésben van. Ha az atomot megcsavarodnák, ezek az orbitálok már nem fedik át egymást és a kötés megszakad. A kettős szén-szén kötés megakadályozza az atomok szabad forgását a molekulákban. Ez a két molekula azonos atomokkal rendelkezik, de eltérő molekulák. Ők
geometriai izomerek egymástól.A geometriai izomer nómenklatúrában a cisz és a transz előtagot arra használjuk, hogy meghatározzuk a kettős kötés melyik oldalát a hasonló atomok. A cis- előtag latinul jelentkezik, amely "ezen az oldalon" jelent. Ebben az esetben a klóratomok a szén-szén kettős kötés azonos oldalán vannak. Ezt az izomert cisz-1,2-diklór-eténnek nevezzük.
Az átalakítás latinul van, azaz "keresztben" jelentése. Ebben az esetben a klóratomok a kettős kötésen helyezkednek el egymástól. Ezt az izomert transz-1,2-diklór-eténnek nevezzük.
Az aliciklusos vegyületek nem aromás gyűrűs molekulák. Ha két szubsztituens atom vagy csoport ugyanabba az irányba hajlik, akkor a molekula előtti cisz. Ez a molekula cisz-1,2-diklór-ciklohexán.
A cisz- és transz-izomerek fizikai tulajdonságai között sok különbség van. A cisz-izomerek általában magasabb forrásponttal rendelkeznek, mint transz-társaik. A transz-izomerek általában alacsonyabbak olvadáspont és alacsonyabb sűrűségűek, mint a cisz-társaik. A cisz-izomerek összegyűjtik a töltést a molekula egyik oldalán, így a molekula teljes poláris hatású. A transz-izomerek kiegyensúlyozzák az egyes dipólokat és nem-poláris hajlammal rendelkeznek.
A sztereoizomereket a cisz- és transz-transz-észtereken kívül más jelöléssel is leírhatunk. Például, az E / Z izomerek konfigurációs izomerek bármilyen forgási korlátozással. Az E-Z rendszert a cisz-transz helyett olyan vegyületeknél alkalmazzák, amelyeknek kettőnél több szubsztituens van. Ha névben használják, az E és a Z dőlt betűvel íródnak.